É o órgano colexiado de goberno da Axencia, ao cal corresponde establecer as directrices de actuación, de acordo coas emanadas da consellería competente en materia de facenda.
Está integrado pola Presidencia, a Vicepresidencia e seis vogais.
Son membros do Consello Reitor:
- A persoa titular da Presidencia, que preside o Consello Reitor.
- A persoa titular da Dirección, a quen corresponde a vicepresidencia.
- A persoa titular do órgano de dirección da Administración xeral da Comunidade Autónoma de Galicia competente en materia de:
- Patrimonio.
- Orzamentos.
- Tesouraría.
- Función pública.
- A persoa titular da Intervención Xeral da Comunidade Autónoma.
- A persoa titular da Dirección Xeral do Centro Informático para a Xestión Tributaria, Económico-Financeira e Contable.